Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E1

Zmiz1, Zinc finger MIZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmiz1Q6P1E1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zmiz1Q6P1E1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zmiz1Q6P1E1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zmiz1Q6P1E1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zmiz1Q6P1E1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zmiz1Q6P1E1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zmiz1Q6P1E1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zmiz1Q6P1E1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zmiz1Q6P1E1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zmiz1Q6P1E1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zmiz1Q6P1E1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zmiz1Q6P1E1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zmiz1Q6P1E1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zmiz1Q6P1E1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zmiz1Q6P1E1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zmiz1Q6P1E1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zmiz1Q6P1E1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zmiz1Q6P1E1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zmiz1Q6P1E1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zmiz1Q6P1E1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zmiz1Q6P1E1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zmiz1Q6P1E1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zmiz1Q6P1E1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zmiz1Q6P1E1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zmiz1Q6P1E1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zmiz1Q6P1E1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zmiz1Q6P1E1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zmiz1Q6P1E1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zmiz1Q6P1E1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zmiz1Q6P1E1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zmiz1Q6P1E1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zmiz1Q6P1E1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zmiz1Q6P1E1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zmiz1Q6P1E1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zmiz1Q6P1E1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zmiz1Q6P1E1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zmiz1Q6P1E1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zmiz1Q6P1E1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zmiz1Q6P1E1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zmiz1Q6P1E1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zmiz1Q6P1E1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zmiz1Q6P1E1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zmiz1Q6P1E1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms