Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
U2surpQ6NV83 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
U2surpQ6NV83 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
U2surpQ6NV83 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
U2surpQ6NV83 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
U2surpQ6NV83 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
U2surpQ6NV83 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
U2surpQ6NV83 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
U2surpQ6NV83 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
U2surpQ6NV83 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
U2surpQ6NV83 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
U2surpQ6NV83 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
U2surpQ6NV83 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
U2surpQ6NV83 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
U2surpQ6NV83 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
U2surpQ6NV83 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
U2surpQ6NV83 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
U2surpQ6NV83 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
U2surpQ6NV83 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
U2surpQ6NV83 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
U2surpQ6NV83 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
U2surpQ6NV83 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
U2surpQ6NV83 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
U2surpQ6NV83 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
U2surpQ6NV83 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
U2surpQ6NV83 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
U2surpQ6NV83 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
U2surpQ6NV83 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
U2surpQ6NV83 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
U2surpQ6NV83 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
U2surpQ6NV83 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
U2surpQ6NV83 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
U2surpQ6NV83 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
U2surpQ6NV83 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
U2surpQ6NV83 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
U2surpQ6NV83 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
U2surpQ6NV83 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
U2surpQ6NV83 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
U2surpQ6NV83 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
U2surpQ6NV83 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
U2surpQ6NV83 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
U2surpQ6NV83 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
U2surpQ6NV83 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
U2surpQ6NV83 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
U2surpQ6NV83 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
U2surpQ6NV83 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
U2surpQ6NV83 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
U2surpQ6NV83 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
U2surpQ6NV83 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
U2surpQ6NV83 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
U2surpQ6NV83 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
U2surpQ6NV83 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
U2surpQ6NV83 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
U2surpQ6NV83 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
U2surpQ6NV83 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
U2surpQ6NV83 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
U2surpQ6NV83 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
U2surpQ6NV83 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
U2surpQ6NV83 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
U2surpQ6NV83 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
U2surpQ6NV83 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
U2surpQ6NV83 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
U2surpQ6NV83 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
U2surpQ6NV83 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
U2surpQ6NV83 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
U2surpQ6NV83 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
U2surpQ6NV83 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
U2surpQ6NV83 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
U2surpQ6NV83 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
U2surpQ6NV83 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
U2surpQ6NV83 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
U2surpQ6NV83 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
U2surpQ6NV83 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
U2surpQ6NV83 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
U2surpQ6NV83 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
U2surpQ6NV83 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
U2surpQ6NV83 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
U2surpQ6NV83 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
U2surpQ6NV83 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
U2surpQ6NV83 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
U2surpQ6NV83 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
U2surpQ6NV83 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
U2surpQ6NV83 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
U2surpQ6NV83 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
U2surpQ6NV83 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
U2surpQ6NV83 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
U2surpQ6NV83 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
U2surpQ6NV83 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
U2surpQ6NV83 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
U2surpQ6NV83 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
U2surpQ6NV83 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
U2surpQ6NV83 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
U2surpQ6NV83 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
U2surpQ6NV83 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
U2surpQ6NV83 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
U2surpQ6NV83 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
U2surpQ6NV83 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
U2surpQ6NV83 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
U2surpQ6NV83 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
U2surpQ6NV83 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms