Protein–RNA interactions for Protein: Q6A051

Atrnl1, Attractin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atrnl1Q6A051 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atrnl1Q6A051 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Atrnl1Q6A051 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atrnl1Q6A051 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atrnl1Q6A051 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atrnl1Q6A051 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atrnl1Q6A051 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atrnl1Q6A051 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atrnl1Q6A051 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atrnl1Q6A051 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atrnl1Q6A051 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atrnl1Q6A051 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atrnl1Q6A051 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Atrnl1Q6A051 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atrnl1Q6A051 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atrnl1Q6A051 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atrnl1Q6A051 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atrnl1Q6A051 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Atrnl1Q6A051 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atrnl1Q6A051 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atrnl1Q6A051 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atrnl1Q6A051 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atrnl1Q6A051 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atrnl1Q6A051 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atrnl1Q6A051 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atrnl1Q6A051 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atrnl1Q6A051 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Atrnl1Q6A051 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atrnl1Q6A051 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atrnl1Q6A051 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atrnl1Q6A051 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Atrnl1Q6A051 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atrnl1Q6A051 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atrnl1Q6A051 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atrnl1Q6A051 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atrnl1Q6A051 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atrnl1Q6A051 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atrnl1Q6A051 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Atrnl1Q6A051 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atrnl1Q6A051 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atrnl1Q6A051 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atrnl1Q6A051 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atrnl1Q6A051 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Atrnl1Q6A051 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atrnl1Q6A051 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atrnl1Q6A051 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atrnl1Q6A051 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atrnl1Q6A051 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atrnl1Q6A051 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Atrnl1Q6A051 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atrnl1Q6A051 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atrnl1Q6A051 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atrnl1Q6A051 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atrnl1Q6A051 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atrnl1Q6A051 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atrnl1Q6A051 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atrnl1Q6A051 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atrnl1Q6A051 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atrnl1Q6A051 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atrnl1Q6A051 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atrnl1Q6A051 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atrnl1Q6A051 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atrnl1Q6A051 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atrnl1Q6A051 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atrnl1Q6A051 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atrnl1Q6A051 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atrnl1Q6A051 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atrnl1Q6A051 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atrnl1Q6A051 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atrnl1Q6A051 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atrnl1Q6A051 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atrnl1Q6A051 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atrnl1Q6A051 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atrnl1Q6A051 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atrnl1Q6A051 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atrnl1Q6A051 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atrnl1Q6A051 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Atrnl1Q6A051 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atrnl1Q6A051 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atrnl1Q6A051 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atrnl1Q6A051 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atrnl1Q6A051 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atrnl1Q6A051 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atrnl1Q6A051 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atrnl1Q6A051 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atrnl1Q6A051 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atrnl1Q6A051 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atrnl1Q6A051 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atrnl1Q6A051 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atrnl1Q6A051 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atrnl1Q6A051 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atrnl1Q6A051 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atrnl1Q6A051 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atrnl1Q6A051 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Atrnl1Q6A051 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atrnl1Q6A051 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atrnl1Q6A051 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atrnl1Q6A051 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atrnl1Q6A051 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atrnl1Q6A051 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms