Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn4Q69Z26 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn4Q69Z26 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn4Q69Z26 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn4Q69Z26 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn4Q69Z26 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn4Q69Z26 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntn4Q69Z26 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntn4Q69Z26 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntn4Q69Z26 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntn4Q69Z26 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntn4Q69Z26 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cntn4Q69Z26 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn4Q69Z26 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn4Q69Z26 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn4Q69Z26 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn4Q69Z26 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn4Q69Z26 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn4Q69Z26 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn4Q69Z26 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn4Q69Z26 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn4Q69Z26 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn4Q69Z26 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn4Q69Z26 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn4Q69Z26 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn4Q69Z26 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn4Q69Z26 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn4Q69Z26 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn4Q69Z26 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn4Q69Z26 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn4Q69Z26 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn4Q69Z26 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn4Q69Z26 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn4Q69Z26 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn4Q69Z26 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn4Q69Z26 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn4Q69Z26 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn4Q69Z26 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn4Q69Z26 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn4Q69Z26 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn4Q69Z26 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn4Q69Z26 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn4Q69Z26 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn4Q69Z26 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn4Q69Z26 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn4Q69Z26 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn4Q69Z26 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn4Q69Z26 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn4Q69Z26 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn4Q69Z26 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn4Q69Z26 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn4Q69Z26 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn4Q69Z26 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn4Q69Z26 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn4Q69Z26 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn4Q69Z26 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn4Q69Z26 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn4Q69Z26 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntn4Q69Z26 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntn4Q69Z26 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntn4Q69Z26 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntn4Q69Z26 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntn4Q69Z26 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn4Q69Z26 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn4Q69Z26 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn4Q69Z26 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn4Q69Z26 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntn4Q69Z26 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntn4Q69Z26 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cntn4Q69Z26 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms