Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs2Q66JT5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tpgs2Q66JT5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpgs2Q66JT5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpgs2Q66JT5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpgs2Q66JT5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpgs2Q66JT5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpgs2Q66JT5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpgs2Q66JT5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpgs2Q66JT5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpgs2Q66JT5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpgs2Q66JT5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpgs2Q66JT5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpgs2Q66JT5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpgs2Q66JT5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpgs2Q66JT5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpgs2Q66JT5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpgs2Q66JT5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpgs2Q66JT5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpgs2Q66JT5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpgs2Q66JT5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpgs2Q66JT5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpgs2Q66JT5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpgs2Q66JT5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpgs2Q66JT5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpgs2Q66JT5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpgs2Q66JT5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpgs2Q66JT5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpgs2Q66JT5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpgs2Q66JT5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpgs2Q66JT5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpgs2Q66JT5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpgs2Q66JT5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpgs2Q66JT5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpgs2Q66JT5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpgs2Q66JT5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpgs2Q66JT5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpgs2Q66JT5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpgs2Q66JT5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpgs2Q66JT5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpgs2Q66JT5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpgs2Q66JT5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpgs2Q66JT5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpgs2Q66JT5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpgs2Q66JT5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpgs2Q66JT5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpgs2Q66JT5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpgs2Q66JT5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpgs2Q66JT5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpgs2Q66JT5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpgs2Q66JT5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpgs2Q66JT5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpgs2Q66JT5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpgs2Q66JT5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpgs2Q66JT5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpgs2Q66JT5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpgs2Q66JT5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpgs2Q66JT5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpgs2Q66JT5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpgs2Q66JT5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpgs2Q66JT5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpgs2Q66JT5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpgs2Q66JT5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpgs2Q66JT5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpgs2Q66JT5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpgs2Q66JT5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpgs2Q66JT5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpgs2Q66JT5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpgs2Q66JT5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpgs2Q66JT5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpgs2Q66JT5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpgs2Q66JT5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpgs2Q66JT5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpgs2Q66JT5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpgs2Q66JT5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpgs2Q66JT5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tpgs2Q66JT5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms