Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnna3Q65CL1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnna3Q65CL1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnna3Q65CL1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnna3Q65CL1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnna3Q65CL1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctnna3Q65CL1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctnna3Q65CL1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctnna3Q65CL1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctnna3Q65CL1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctnna3Q65CL1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctnna3Q65CL1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctnna3Q65CL1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ctnna3Q65CL1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ctnna3Q65CL1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ctnna3Q65CL1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ctnna3Q65CL1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ctnna3Q65CL1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ctnna3Q65CL1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctnna3Q65CL1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctnna3Q65CL1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctnna3Q65CL1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctnna3Q65CL1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctnna3Q65CL1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctnna3Q65CL1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctnna3Q65CL1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctnna3Q65CL1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctnna3Q65CL1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctnna3Q65CL1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctnna3Q65CL1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctnna3Q65CL1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctnna3Q65CL1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctnna3Q65CL1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctnna3Q65CL1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctnna3Q65CL1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctnna3Q65CL1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctnna3Q65CL1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctnna3Q65CL1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctnna3Q65CL1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctnna3Q65CL1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctnna3Q65CL1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctnna3Q65CL1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctnna3Q65CL1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctnna3Q65CL1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctnna3Q65CL1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctnna3Q65CL1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctnna3Q65CL1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctnna3Q65CL1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctnna3Q65CL1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctnna3Q65CL1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctnna3Q65CL1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctnna3Q65CL1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctnna3Q65CL1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctnna3Q65CL1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctnna3Q65CL1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctnna3Q65CL1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctnna3Q65CL1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctnna3Q65CL1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctnna3Q65CL1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctnna3Q65CL1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctnna3Q65CL1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctnna3Q65CL1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctnna3Q65CL1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctnna3Q65CL1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctnna3Q65CL1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctnna3Q65CL1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctnna3Q65CL1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctnna3Q65CL1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctnna3Q65CL1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctnna3Q65CL1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctnna3Q65CL1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctnna3Q65CL1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctnna3Q65CL1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctnna3Q65CL1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctnna3Q65CL1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctnna3Q65CL1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctnna3Q65CL1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctnna3Q65CL1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctnna3Q65CL1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctnna3Q65CL1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctnna3Q65CL1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctnna3Q65CL1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctnna3Q65CL1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctnna3Q65CL1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctnna3Q65CL1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ctnna3Q65CL1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctnna3Q65CL1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctnna3Q65CL1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctnna3Q65CL1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctnna3Q65CL1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctnna3Q65CL1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctnna3Q65CL1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctnna3Q65CL1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctnna3Q65CL1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctnna3Q65CL1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctnna3Q65CL1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctnna3Q65CL1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctnna3Q65CL1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctnna3Q65CL1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctnna3Q65CL1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms