Protein–RNA interactions for Protein: Q64318

Zeb1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb1Q64318 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Zeb1Q64318 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Zeb1Q64318 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Zeb1Q64318 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Zeb1Q64318 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Zeb1Q64318 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Zeb1Q64318 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Zeb1Q64318 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Zeb1Q64318 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Zeb1Q64318 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Zeb1Q64318 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Zeb1Q64318 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Zeb1Q64318 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Zeb1Q64318 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Zeb1Q64318 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Zeb1Q64318 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Zeb1Q64318 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Zeb1Q64318 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Zeb1Q64318 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Zeb1Q64318 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Zeb1Q64318 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Zeb1Q64318 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Zeb1Q64318 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Zeb1Q64318 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Zeb1Q64318 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Zeb1Q64318 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Zeb1Q64318 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Zeb1Q64318 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Zeb1Q64318 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Zeb1Q64318 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Zeb1Q64318 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Zeb1Q64318 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Zeb1Q64318 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Zeb1Q64318 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Zeb1Q64318 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Zeb1Q64318 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Zeb1Q64318 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Zeb1Q64318 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Zeb1Q64318 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Zeb1Q64318 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Zeb1Q64318 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Zeb1Q64318 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Zeb1Q64318 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Zeb1Q64318 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Zeb1Q64318 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Zeb1Q64318 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Zeb1Q64318 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Zeb1Q64318 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Zeb1Q64318 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Zeb1Q64318 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Zeb1Q64318 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Zeb1Q64318 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Zeb1Q64318 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Zeb1Q64318 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Zeb1Q64318 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Zeb1Q64318 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Zeb1Q64318 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Zeb1Q64318 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Zeb1Q64318 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Zeb1Q64318 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Zeb1Q64318 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Zeb1Q64318 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Zeb1Q64318 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Zeb1Q64318 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Zeb1Q64318 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Zeb1Q64318 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Zeb1Q64318 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Zeb1Q64318 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Zeb1Q64318 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Zeb1Q64318 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Zeb1Q64318 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Zeb1Q64318 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Zeb1Q64318 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Zeb1Q64318 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Zeb1Q64318 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Zeb1Q64318 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Zeb1Q64318 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Zeb1Q64318 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Zeb1Q64318 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Zeb1Q64318 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Zeb1Q64318 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Zeb1Q64318 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Zeb1Q64318 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Zeb1Q64318 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Zeb1Q64318 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Zeb1Q64318 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Zeb1Q64318 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Zeb1Q64318 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Zeb1Q64318 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Zeb1Q64318 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Zeb1Q64318 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Zeb1Q64318 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Zeb1Q64318 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Zeb1Q64318 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Zeb1Q64318 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Zeb1Q64318 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Zeb1Q64318 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Zeb1Q64318 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Zeb1Q64318 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Zeb1Q64318 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms