Protein–RNA interactions for Protein: Q640L3

Ccpg1, Cell cycle progression protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccpg1Q640L3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccpg1Q640L3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccpg1Q640L3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccpg1Q640L3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccpg1Q640L3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccpg1Q640L3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccpg1Q640L3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccpg1Q640L3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccpg1Q640L3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccpg1Q640L3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccpg1Q640L3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccpg1Q640L3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccpg1Q640L3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccpg1Q640L3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccpg1Q640L3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccpg1Q640L3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccpg1Q640L3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccpg1Q640L3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccpg1Q640L3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccpg1Q640L3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccpg1Q640L3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccpg1Q640L3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccpg1Q640L3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccpg1Q640L3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccpg1Q640L3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccpg1Q640L3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccpg1Q640L3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccpg1Q640L3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccpg1Q640L3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccpg1Q640L3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccpg1Q640L3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccpg1Q640L3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccpg1Q640L3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccpg1Q640L3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccpg1Q640L3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccpg1Q640L3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccpg1Q640L3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccpg1Q640L3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccpg1Q640L3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccpg1Q640L3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccpg1Q640L3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccpg1Q640L3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccpg1Q640L3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccpg1Q640L3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccpg1Q640L3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccpg1Q640L3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccpg1Q640L3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccpg1Q640L3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccpg1Q640L3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccpg1Q640L3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccpg1Q640L3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccpg1Q640L3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccpg1Q640L3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccpg1Q640L3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccpg1Q640L3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccpg1Q640L3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccpg1Q640L3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccpg1Q640L3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccpg1Q640L3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccpg1Q640L3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccpg1Q640L3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccpg1Q640L3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccpg1Q640L3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccpg1Q640L3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccpg1Q640L3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms