Protein–RNA interactions for Protein: Q64008

Rab34, Ras-related protein Rab-34, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab34Q64008 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab34Q64008 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab34Q64008 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab34Q64008 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab34Q64008 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab34Q64008 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab34Q64008 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab34Q64008 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab34Q64008 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab34Q64008 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab34Q64008 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab34Q64008 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab34Q64008 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab34Q64008 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab34Q64008 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab34Q64008 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab34Q64008 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab34Q64008 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab34Q64008 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab34Q64008 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab34Q64008 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab34Q64008 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rab34Q64008 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab34Q64008 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab34Q64008 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab34Q64008 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab34Q64008 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab34Q64008 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab34Q64008 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab34Q64008 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab34Q64008 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab34Q64008 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab34Q64008 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab34Q64008 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab34Q64008 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab34Q64008 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab34Q64008 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab34Q64008 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab34Q64008 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab34Q64008 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab34Q64008 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab34Q64008 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab34Q64008 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab34Q64008 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab34Q64008 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab34Q64008 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab34Q64008 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms