Protein–RNA interactions for Protein: Q63934

Pou4f2, POU domain, class 4, transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f2Q63934 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pou4f2Q63934 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pou4f2Q63934 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pou4f2Q63934 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pou4f2Q63934 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pou4f2Q63934 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pou4f2Q63934 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pou4f2Q63934 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pou4f2Q63934 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pou4f2Q63934 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pou4f2Q63934 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pou4f2Q63934 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pou4f2Q63934 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pou4f2Q63934 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pou4f2Q63934 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pou4f2Q63934 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pou4f2Q63934 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pou4f2Q63934 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pou4f2Q63934 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pou4f2Q63934 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pou4f2Q63934 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pou4f2Q63934 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pou4f2Q63934 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pou4f2Q63934 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pou4f2Q63934 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pou4f2Q63934 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pou4f2Q63934 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pou4f2Q63934 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou4f2Q63934 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou4f2Q63934 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou4f2Q63934 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou4f2Q63934 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou4f2Q63934 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou4f2Q63934 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou4f2Q63934 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou4f2Q63934 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pou4f2Q63934 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms