Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Kdm5dQ62240 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Kdm5dQ62240 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
Kdm5dQ62240 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.63
Kdm5dQ62240 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
Kdm5dQ62240 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
Kdm5dQ62240 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC43.92■■■■■ 4.62
Kdm5dQ62240 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
Kdm5dQ62240 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
Kdm5dQ62240 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
Kdm5dQ62240 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
Kdm5dQ62240 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
Kdm5dQ62240 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
Kdm5dQ62240 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
Kdm5dQ62240 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
Kdm5dQ62240 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
Kdm5dQ62240 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC43.88■■■■■ 4.61
Kdm5dQ62240 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.61
Kdm5dQ62240 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC43.88■■■■■ 4.61
Kdm5dQ62240 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC43.87■■■■■ 4.61
Kdm5dQ62240 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
Kdm5dQ62240 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
Kdm5dQ62240 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC43.87■■■■■ 4.61
Kdm5dQ62240 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
Kdm5dQ62240 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
Kdm5dQ62240 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
Kdm5dQ62240 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.61
Kdm5dQ62240 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
Kdm5dQ62240 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.6
Kdm5dQ62240 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
Kdm5dQ62240 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
Kdm5dQ62240 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
Kdm5dQ62240 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
Kdm5dQ62240 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
Kdm5dQ62240 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC43.8■■■■■ 4.6
Kdm5dQ62240 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
Kdm5dQ62240 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
Kdm5dQ62240 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
Kdm5dQ62240 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
Kdm5dQ62240 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
Kdm5dQ62240 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.75■■■■■ 4.59
Kdm5dQ62240 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Kdm5dQ62240 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC43.74■■■■■ 4.59
Kdm5dQ62240 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC43.74■■■■■ 4.59
Kdm5dQ62240 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Kdm5dQ62240 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Kdm5dQ62240 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Kdm5dQ62240 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
Kdm5dQ62240 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.72■■■■■ 4.59
Kdm5dQ62240 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
Kdm5dQ62240 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
Kdm5dQ62240 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
Kdm5dQ62240 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
Kdm5dQ62240 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
Kdm5dQ62240 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC43.71■■■■■ 4.59
Kdm5dQ62240 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
Kdm5dQ62240 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.59
Kdm5dQ62240 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
Kdm5dQ62240 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
Kdm5dQ62240 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
Kdm5dQ62240 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
Kdm5dQ62240 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
Kdm5dQ62240 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
Kdm5dQ62240 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
Kdm5dQ62240 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
Kdm5dQ62240 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
Kdm5dQ62240 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
Kdm5dQ62240 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC43.64■■■■■ 4.58
Kdm5dQ62240 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC43.64■■■■■ 4.58
Kdm5dQ62240 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC43.64■■■■■ 4.58
Kdm5dQ62240 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
Kdm5dQ62240 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC43.63■■■■■ 4.58
Kdm5dQ62240 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC43.63■■■■■ 4.57
Kdm5dQ62240 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
Kdm5dQ62240 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC43.62■■■■■ 4.57
Kdm5dQ62240 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Kdm5dQ62240 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Kdm5dQ62240 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
Kdm5dQ62240 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
Kdm5dQ62240 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
Kdm5dQ62240 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
Kdm5dQ62240 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
Kdm5dQ62240 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Kdm5dQ62240 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.56
Kdm5dQ62240 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
Kdm5dQ62240 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
Kdm5dQ62240 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC43.55■■■■■ 4.56
Kdm5dQ62240 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC43.55■■■■■ 4.56
Kdm5dQ62240 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC43.55■■■■■ 4.56
Kdm5dQ62240 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC43.55■■■■■ 4.56
Kdm5dQ62240 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC43.55■■■■■ 4.56
Kdm5dQ62240 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
Kdm5dQ62240 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Kdm5dQ62240 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
Kdm5dQ62240 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
Kdm5dQ62240 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
Kdm5dQ62240 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
Kdm5dQ62240 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC43.52■■■■■ 4.56
Kdm5dQ62240 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC43.52■■■■■ 4.56
Kdm5dQ62240 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms