Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Six3Q62233 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Six3Q62233 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Six3Q62233 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Six3Q62233 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Six3Q62233 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Six3Q62233 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Six3Q62233 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Six3Q62233 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Six3Q62233 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Six3Q62233 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Six3Q62233 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Six3Q62233 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Six3Q62233 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Six3Q62233 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Six3Q62233 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Six3Q62233 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Six3Q62233 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Six3Q62233 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Six3Q62233 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Six3Q62233 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Six3Q62233 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Six3Q62233 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Six3Q62233 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Six3Q62233 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Six3Q62233 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Six3Q62233 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Six3Q62233 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Six3Q62233 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Six3Q62233 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Six3Q62233 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six3Q62233 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six3Q62233 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Six3Q62233 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Six3Q62233 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Six3Q62233 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Six3Q62233 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Six3Q62233 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Six3Q62233 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Six3Q62233 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Six3Q62233 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Six3Q62233 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Six3Q62233 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Six3Q62233 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Six3Q62233 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Six3Q62233 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Six3Q62233 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Six3Q62233 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Six3Q62233 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Six3Q62233 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Six3Q62233 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Six3Q62233 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Six3Q62233 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Six3Q62233 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Six3Q62233 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Six3Q62233 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Six3Q62233 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Six3Q62233 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Six3Q62233 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Six3Q62233 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Six3Q62233 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Six3Q62233 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Six3Q62233 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Six3Q62233 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Six3Q62233 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Six3Q62233 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Six3Q62233 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Six3Q62233 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Six3Q62233 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Six3Q62233 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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