Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttf1Q62187 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttf1Q62187 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttf1Q62187 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttf1Q62187 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttf1Q62187 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttf1Q62187 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttf1Q62187 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttf1Q62187 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttf1Q62187 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttf1Q62187 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttf1Q62187 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttf1Q62187 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttf1Q62187 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttf1Q62187 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttf1Q62187 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttf1Q62187 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttf1Q62187 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttf1Q62187 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttf1Q62187 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttf1Q62187 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttf1Q62187 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ttf1Q62187 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttf1Q62187 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttf1Q62187 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttf1Q62187 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttf1Q62187 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttf1Q62187 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttf1Q62187 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttf1Q62187 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttf1Q62187 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttf1Q62187 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttf1Q62187 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttf1Q62187 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttf1Q62187 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttf1Q62187 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttf1Q62187 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttf1Q62187 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttf1Q62187 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttf1Q62187 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttf1Q62187 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttf1Q62187 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttf1Q62187 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttf1Q62187 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttf1Q62187 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttf1Q62187 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttf1Q62187 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttf1Q62187 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttf1Q62187 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttf1Q62187 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttf1Q62187 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ttf1Q62187 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms