Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Aldh1a2Q62148 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Aldh1a2Q62148 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aldh1a2Q62148 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Aldh1a2Q62148 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Aldh1a2Q62148 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Aldh1a2Q62148 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Aldh1a2Q62148 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Aldh1a2Q62148 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Aldh1a2Q62148 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Aldh1a2Q62148 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aldh1a2Q62148 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aldh1a2Q62148 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aldh1a2Q62148 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aldh1a2Q62148 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aldh1a2Q62148 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aldh1a2Q62148 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aldh1a2Q62148 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aldh1a2Q62148 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aldh1a2Q62148 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aldh1a2Q62148 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aldh1a2Q62148 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aldh1a2Q62148 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aldh1a2Q62148 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aldh1a2Q62148 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aldh1a2Q62148 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aldh1a2Q62148 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aldh1a2Q62148 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aldh1a2Q62148 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aldh1a2Q62148 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Aldh1a2Q62148 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aldh1a2Q62148 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aldh1a2Q62148 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Aldh1a2Q62148 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Aldh1a2Q62148 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Aldh1a2Q62148 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Aldh1a2Q62148 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Aldh1a2Q62148 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Aldh1a2Q62148 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Aldh1a2Q62148 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Aldh1a2Q62148 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Aldh1a2Q62148 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aldh1a2Q62148 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aldh1a2Q62148 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aldh1a2Q62148 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aldh1a2Q62148 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aldh1a2Q62148 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aldh1a2Q62148 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Aldh1a2Q62148 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aldh1a2Q62148 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aldh1a2Q62148 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aldh1a2Q62148 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aldh1a2Q62148 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aldh1a2Q62148 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aldh1a2Q62148 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aldh1a2Q62148 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Aldh1a2Q62148 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Aldh1a2Q62148 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Aldh1a2Q62148 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Aldh1a2Q62148 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Aldh1a2Q62148 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aldh1a2Q62148 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aldh1a2Q62148 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aldh1a2Q62148 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aldh1a2Q62148 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aldh1a2Q62148 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aldh1a2Q62148 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aldh1a2Q62148 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.5 ms