Protein–RNA interactions for Protein: Q62029

Pabpc2, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc2Q62029 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc2Q62029 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc2Q62029 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc2Q62029 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc2Q62029 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pabpc2Q62029 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pabpc2Q62029 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pabpc2Q62029 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc2Q62029 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc2Q62029 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc2Q62029 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc2Q62029 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc2Q62029 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc2Q62029 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc2Q62029 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc2Q62029 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc2Q62029 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc2Q62029 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc2Q62029 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc2Q62029 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc2Q62029 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc2Q62029 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc2Q62029 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc2Q62029 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc2Q62029 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc2Q62029 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc2Q62029 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc2Q62029 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pabpc2Q62029 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc2Q62029 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc2Q62029 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc2Q62029 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc2Q62029 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc2Q62029 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc2Q62029 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc2Q62029 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc2Q62029 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc2Q62029 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc2Q62029 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc2Q62029 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc2Q62029 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc2Q62029 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc2Q62029 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc2Q62029 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc2Q62029 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc2Q62029 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc2Q62029 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc2Q62029 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc2Q62029 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc2Q62029 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc2Q62029 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc2Q62029 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc2Q62029 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc2Q62029 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc2Q62029 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc2Q62029 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc2Q62029 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc2Q62029 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc2Q62029 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms