Protein–RNA interactions for Protein: Q61456

Ccna1, Cyclin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna1Q61456 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccna1Q61456 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccna1Q61456 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccna1Q61456 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccna1Q61456 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccna1Q61456 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccna1Q61456 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccna1Q61456 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccna1Q61456 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccna1Q61456 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccna1Q61456 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccna1Q61456 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccna1Q61456 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccna1Q61456 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccna1Q61456 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccna1Q61456 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccna1Q61456 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccna1Q61456 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccna1Q61456 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccna1Q61456 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccna1Q61456 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccna1Q61456 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccna1Q61456 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccna1Q61456 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccna1Q61456 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccna1Q61456 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccna1Q61456 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccna1Q61456 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.9 ms