Protein–RNA interactions for Protein: Q61088

Fzd4, Frizzled-4, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fzd4Q61088 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fzd4Q61088 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fzd4Q61088 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fzd4Q61088 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fzd4Q61088 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fzd4Q61088 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fzd4Q61088 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fzd4Q61088 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Fzd4Q61088 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fzd4Q61088 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fzd4Q61088 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fzd4Q61088 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fzd4Q61088 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fzd4Q61088 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fzd4Q61088 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fzd4Q61088 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fzd4Q61088 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fzd4Q61088 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fzd4Q61088 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fzd4Q61088 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fzd4Q61088 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fzd4Q61088 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fzd4Q61088 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fzd4Q61088 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fzd4Q61088 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fzd4Q61088 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fzd4Q61088 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fzd4Q61088 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fzd4Q61088 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fzd4Q61088 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fzd4Q61088 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fzd4Q61088 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fzd4Q61088 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fzd4Q61088 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fzd4Q61088 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fzd4Q61088 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fzd4Q61088 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fzd4Q61088 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fzd4Q61088 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fzd4Q61088 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fzd4Q61088 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fzd4Q61088 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fzd4Q61088 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fzd4Q61088 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fzd4Q61088 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fzd4Q61088 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fzd4Q61088 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fzd4Q61088 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fzd4Q61088 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fzd4Q61088 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fzd4Q61088 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fzd4Q61088 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fzd4Q61088 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fzd4Q61088 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fzd4Q61088 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fzd4Q61088 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fzd4Q61088 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fzd4Q61088 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fzd4Q61088 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fzd4Q61088 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fzd4Q61088 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fzd4Q61088 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fzd4Q61088 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fzd4Q61088 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fzd4Q61088 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms