Protein–RNA interactions for Protein: Q61079

Sim2, Single-minded homolog 2, mousemouse

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim2Q61079 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sim2Q61079 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sim2Q61079 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sim2Q61079 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sim2Q61079 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sim2Q61079 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sim2Q61079 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sim2Q61079 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sim2Q61079 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sim2Q61079 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sim2Q61079 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sim2Q61079 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sim2Q61079 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sim2Q61079 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sim2Q61079 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sim2Q61079 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sim2Q61079 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sim2Q61079 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sim2Q61079 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sim2Q61079 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sim2Q61079 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sim2Q61079 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sim2Q61079 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sim2Q61079 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sim2Q61079 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sim2Q61079 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sim2Q61079 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sim2Q61079 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sim2Q61079 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sim2Q61079 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sim2Q61079 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sim2Q61079 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sim2Q61079 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sim2Q61079 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sim2Q61079 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sim2Q61079 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sim2Q61079 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sim2Q61079 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sim2Q61079 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sim2Q61079 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sim2Q61079 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sim2Q61079 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sim2Q61079 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sim2Q61079 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sim2Q61079 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sim2Q61079 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sim2Q61079 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sim2Q61079 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sim2Q61079 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sim2Q61079 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sim2Q61079 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sim2Q61079 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sim2Q61079 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sim2Q61079 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sim2Q61079 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sim2Q61079 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sim2Q61079 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sim2Q61079 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sim2Q61079 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sim2Q61079 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sim2Q61079 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sim2Q61079 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sim2Q61079 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sim2Q61079 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Sim2Q61079 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sim2Q61079 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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