Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Kpna1Q60960 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kpna1Q60960 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kpna1Q60960 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kpna1Q60960 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kpna1Q60960 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Kpna1Q60960 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kpna1Q60960 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kpna1Q60960 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kpna1Q60960 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kpna1Q60960 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kpna1Q60960 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kpna1Q60960 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Kpna1Q60960 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kpna1Q60960 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kpna1Q60960 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kpna1Q60960 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kpna1Q60960 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kpna1Q60960 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kpna1Q60960 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kpna1Q60960 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kpna1Q60960 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Kpna1Q60960 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kpna1Q60960 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kpna1Q60960 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kpna1Q60960 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kpna1Q60960 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kpna1Q60960 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kpna1Q60960 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kpna1Q60960 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kpna1Q60960 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kpna1Q60960 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kpna1Q60960 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Kpna1Q60960 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kpna1Q60960 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Kpna1Q60960 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kpna1Q60960 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kpna1Q60960 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kpna1Q60960 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kpna1Q60960 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Kpna1Q60960 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kpna1Q60960 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kpna1Q60960 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kpna1Q60960 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kpna1Q60960 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kpna1Q60960 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kpna1Q60960 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kpna1Q60960 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kpna1Q60960 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kpna1Q60960 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Kpna1Q60960 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Kpna1Q60960 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kpna1Q60960 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kpna1Q60960 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kpna1Q60960 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kpna1Q60960 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kpna1Q60960 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kpna1Q60960 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kpna1Q60960 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kpna1Q60960 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kpna1Q60960 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Kpna1Q60960 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kpna1Q60960 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kpna1Q60960 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kpna1Q60960 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Kpna1Q60960 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kpna1Q60960 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kpna1Q60960 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Kpna1Q60960 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kpna1Q60960 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kpna1Q60960 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kpna1Q60960 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kpna1Q60960 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kpna1Q60960 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kpna1Q60960 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kpna1Q60960 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kpna1Q60960 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kpna1Q60960 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kpna1Q60960 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kpna1Q60960 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kpna1Q60960 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kpna1Q60960 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kpna1Q60960 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Kpna1Q60960 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kpna1Q60960 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kpna1Q60960 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kpna1Q60960 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kpna1Q60960 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kpna1Q60960 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kpna1Q60960 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kpna1Q60960 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kpna1Q60960 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kpna1Q60960 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kpna1Q60960 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kpna1Q60960 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kpna1Q60960 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kpna1Q60960 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kpna1Q60960 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kpna1Q60960 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Kpna1Q60960 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms