Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Atf3Q60765 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Atf3Q60765 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Atf3Q60765 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Atf3Q60765 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Atf3Q60765 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Atf3Q60765 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Atf3Q60765 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Atf3Q60765 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Atf3Q60765 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Atf3Q60765 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Atf3Q60765 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Atf3Q60765 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Atf3Q60765 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Atf3Q60765 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Atf3Q60765 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Atf3Q60765 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Atf3Q60765 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Atf3Q60765 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Atf3Q60765 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Atf3Q60765 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Atf3Q60765 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Atf3Q60765 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Atf3Q60765 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Atf3Q60765 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Atf3Q60765 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Atf3Q60765 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Atf3Q60765 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Atf3Q60765 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Atf3Q60765 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Atf3Q60765 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Atf3Q60765 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Atf3Q60765 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Atf3Q60765 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Atf3Q60765 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Atf3Q60765 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Atf3Q60765 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Atf3Q60765 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Atf3Q60765 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Atf3Q60765 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Atf3Q60765 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Atf3Q60765 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Atf3Q60765 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Atf3Q60765 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Atf3Q60765 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Atf3Q60765 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Atf3Q60765 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Atf3Q60765 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Atf3Q60765 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Atf3Q60765 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Atf3Q60765 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Atf3Q60765 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Atf3Q60765 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Atf3Q60765 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Atf3Q60765 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Atf3Q60765 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Atf3Q60765 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Atf3Q60765 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Atf3Q60765 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Atf3Q60765 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Atf3Q60765 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Atf3Q60765 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Atf3Q60765 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Atf3Q60765 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Atf3Q60765 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Atf3Q60765 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Atf3Q60765 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Atf3Q60765 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Atf3Q60765 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Atf3Q60765 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Atf3Q60765 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Atf3Q60765 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Atf3Q60765 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Atf3Q60765 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Atf3Q60765 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
Atf3Q60765 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Atf3Q60765 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Atf3Q60765 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Atf3Q60765 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Atf3Q60765 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Atf3Q60765 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Atf3Q60765 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Atf3Q60765 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Atf3Q60765 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Atf3Q60765 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Atf3Q60765 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Atf3Q60765 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Atf3Q60765 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Atf3Q60765 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Atf3Q60765 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Atf3Q60765 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Atf3Q60765 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Atf3Q60765 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Atf3Q60765 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Atf3Q60765 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Atf3Q60765 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Atf3Q60765 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Atf3Q60765 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Atf3Q60765 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Atf3Q60765 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms