Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprnQ60673 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprnQ60673 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprnQ60673 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprnQ60673 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprnQ60673 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprnQ60673 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprnQ60673 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprnQ60673 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprnQ60673 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprnQ60673 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprnQ60673 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprnQ60673 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprnQ60673 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprnQ60673 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprnQ60673 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprnQ60673 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprnQ60673 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprnQ60673 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprnQ60673 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprnQ60673 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprnQ60673 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprnQ60673 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprnQ60673 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprnQ60673 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprnQ60673 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprnQ60673 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprnQ60673 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprnQ60673 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprnQ60673 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms