Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nr2f1Q60632 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nr2f1Q60632 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nr2f1Q60632 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nr2f1Q60632 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nr2f1Q60632 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nr2f1Q60632 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nr2f1Q60632 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nr2f1Q60632 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nr2f1Q60632 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nr2f1Q60632 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nr2f1Q60632 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nr2f1Q60632 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nr2f1Q60632 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nr2f1Q60632 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nr2f1Q60632 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nr2f1Q60632 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nr2f1Q60632 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nr2f1Q60632 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr2f1Q60632 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr2f1Q60632 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr2f1Q60632 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr2f1Q60632 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr2f1Q60632 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr2f1Q60632 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr2f1Q60632 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nr2f1Q60632 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Nr2f1Q60632 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Nr2f1Q60632 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nr2f1Q60632 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr2f1Q60632 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr2f1Q60632 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr2f1Q60632 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr2f1Q60632 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr2f1Q60632 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nr2f1Q60632 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nr2f1Q60632 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nr2f1Q60632 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nr2f1Q60632 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nr2f1Q60632 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nr2f1Q60632 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nr2f1Q60632 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nr2f1Q60632 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nr2f1Q60632 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nr2f1Q60632 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nr2f1Q60632 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nr2f1Q60632 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nr2f1Q60632 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nr2f1Q60632 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr2f1Q60632 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr2f1Q60632 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr2f1Q60632 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr2f1Q60632 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr2f1Q60632 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr2f1Q60632 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr2f1Q60632 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nr2f1Q60632 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nr2f1Q60632 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nr2f1Q60632 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nr2f1Q60632 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nr2f1Q60632 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nr2f1Q60632 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nr2f1Q60632 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nr2f1Q60632 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nr2f1Q60632 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nr2f1Q60632 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms