Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CttnQ60598 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CttnQ60598 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CttnQ60598 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CttnQ60598 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CttnQ60598 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CttnQ60598 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CttnQ60598 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CttnQ60598 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CttnQ60598 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CttnQ60598 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CttnQ60598 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CttnQ60598 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CttnQ60598 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CttnQ60598 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CttnQ60598 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CttnQ60598 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CttnQ60598 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CttnQ60598 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CttnQ60598 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CttnQ60598 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CttnQ60598 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CttnQ60598 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CttnQ60598 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CttnQ60598 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CttnQ60598 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CttnQ60598 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CttnQ60598 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CttnQ60598 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CttnQ60598 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CttnQ60598 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CttnQ60598 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CttnQ60598 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CttnQ60598 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CttnQ60598 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CttnQ60598 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CttnQ60598 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CttnQ60598 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CttnQ60598 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CttnQ60598 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CttnQ60598 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CttnQ60598 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CttnQ60598 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CttnQ60598 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CttnQ60598 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CttnQ60598 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CttnQ60598 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CttnQ60598 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CttnQ60598 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CttnQ60598 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CttnQ60598 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CttnQ60598 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CttnQ60598 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CttnQ60598 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CttnQ60598 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CttnQ60598 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CttnQ60598 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CttnQ60598 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CttnQ60598 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CttnQ60598 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CttnQ60598 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CttnQ60598 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CttnQ60598 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CttnQ60598 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CttnQ60598 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CttnQ60598 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CttnQ60598 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CttnQ60598 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CttnQ60598 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CttnQ60598 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CttnQ60598 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CttnQ60598 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CttnQ60598 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CttnQ60598 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CttnQ60598 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CttnQ60598 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms