Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ssh2Q5SW75 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ssh2Q5SW75 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ssh2Q5SW75 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ssh2Q5SW75 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ssh2Q5SW75 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ssh2Q5SW75 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ssh2Q5SW75 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ssh2Q5SW75 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ssh2Q5SW75 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ssh2Q5SW75 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ssh2Q5SW75 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Ssh2Q5SW75 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ssh2Q5SW75 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ssh2Q5SW75 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ssh2Q5SW75 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ssh2Q5SW75 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ssh2Q5SW75 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Ssh2Q5SW75 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Ssh2Q5SW75 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ssh2Q5SW75 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ssh2Q5SW75 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Ssh2Q5SW75 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ssh2Q5SW75 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ssh2Q5SW75 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ssh2Q5SW75 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ssh2Q5SW75 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ssh2Q5SW75 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ssh2Q5SW75 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ssh2Q5SW75 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ssh2Q5SW75 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ssh2Q5SW75 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ssh2Q5SW75 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Ssh2Q5SW75 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ssh2Q5SW75 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ssh2Q5SW75 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ssh2Q5SW75 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ssh2Q5SW75 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ssh2Q5SW75 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ssh2Q5SW75 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ssh2Q5SW75 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ssh2Q5SW75 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Ssh2Q5SW75 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ssh2Q5SW75 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ssh2Q5SW75 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ssh2Q5SW75 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ssh2Q5SW75 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ssh2Q5SW75 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ssh2Q5SW75 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ssh2Q5SW75 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Ssh2Q5SW75 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ssh2Q5SW75 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ssh2Q5SW75 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Ssh2Q5SW75 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ssh2Q5SW75 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ssh2Q5SW75 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ssh2Q5SW75 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ssh2Q5SW75 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ssh2Q5SW75 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ssh2Q5SW75 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ssh2Q5SW75 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ssh2Q5SW75 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ssh2Q5SW75 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ssh2Q5SW75 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ssh2Q5SW75 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ssh2Q5SW75 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ssh2Q5SW75 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ssh2Q5SW75 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ssh2Q5SW75 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Ssh2Q5SW75 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ssh2Q5SW75 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ssh2Q5SW75 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ssh2Q5SW75 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ssh2Q5SW75 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ssh2Q5SW75 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ssh2Q5SW75 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ssh2Q5SW75 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ssh2Q5SW75 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Ssh2Q5SW75 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ssh2Q5SW75 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ssh2Q5SW75 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ssh2Q5SW75 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ssh2Q5SW75 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ssh2Q5SW75 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ssh2Q5SW75 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ssh2Q5SW75 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Ssh2Q5SW75 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ssh2Q5SW75 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ssh2Q5SW75 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ssh2Q5SW75 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ssh2Q5SW75 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ssh2Q5SW75 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ssh2Q5SW75 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ssh2Q5SW75 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ssh2Q5SW75 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ssh2Q5SW75 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ssh2Q5SW75 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ssh2Q5SW75 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ssh2Q5SW75 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ssh2Q5SW75 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.9 ms