Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam71bQ5STT6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam71bQ5STT6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam71bQ5STT6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam71bQ5STT6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam71bQ5STT6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam71bQ5STT6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam71bQ5STT6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam71bQ5STT6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam71bQ5STT6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam71bQ5STT6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam71bQ5STT6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam71bQ5STT6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam71bQ5STT6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam71bQ5STT6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam71bQ5STT6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam71bQ5STT6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam71bQ5STT6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam71bQ5STT6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam71bQ5STT6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam71bQ5STT6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam71bQ5STT6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam71bQ5STT6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fam71bQ5STT6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fam71bQ5STT6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Fam71bQ5STT6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam71bQ5STT6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam71bQ5STT6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms