Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sft2d1Q5SSN7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sft2d1Q5SSN7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms