Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH8

Cyb5d2, Neuferricin, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb5d2Q5SSH8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cyb5d2Q5SSH8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyb5d2Q5SSH8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyb5d2Q5SSH8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyb5d2Q5SSH8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cyb5d2Q5SSH8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyb5d2Q5SSH8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyb5d2Q5SSH8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cyb5d2Q5SSH8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyb5d2Q5SSH8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyb5d2Q5SSH8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyb5d2Q5SSH8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyb5d2Q5SSH8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyb5d2Q5SSH8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyb5d2Q5SSH8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyb5d2Q5SSH8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyb5d2Q5SSH8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyb5d2Q5SSH8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cyb5d2Q5SSH8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyb5d2Q5SSH8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cyb5d2Q5SSH8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyb5d2Q5SSH8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyb5d2Q5SSH8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cyb5d2Q5SSH8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyb5d2Q5SSH8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyb5d2Q5SSH8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyb5d2Q5SSH8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cyb5d2Q5SSH8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyb5d2Q5SSH8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyb5d2Q5SSH8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cyb5d2Q5SSH8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cyb5d2Q5SSH8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cyb5d2Q5SSH8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyb5d2Q5SSH8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyb5d2Q5SSH8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyb5d2Q5SSH8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyb5d2Q5SSH8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyb5d2Q5SSH8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyb5d2Q5SSH8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyb5d2Q5SSH8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyb5d2Q5SSH8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyb5d2Q5SSH8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyb5d2Q5SSH8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyb5d2Q5SSH8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyb5d2Q5SSH8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyb5d2Q5SSH8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyb5d2Q5SSH8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyb5d2Q5SSH8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyb5d2Q5SSH8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyb5d2Q5SSH8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyb5d2Q5SSH8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyb5d2Q5SSH8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyb5d2Q5SSH8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyb5d2Q5SSH8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyb5d2Q5SSH8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyb5d2Q5SSH8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyb5d2Q5SSH8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyb5d2Q5SSH8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyb5d2Q5SSH8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyb5d2Q5SSH8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyb5d2Q5SSH8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyb5d2Q5SSH8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyb5d2Q5SSH8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyb5d2Q5SSH8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyb5d2Q5SSH8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyb5d2Q5SSH8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyb5d2Q5SSH8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyb5d2Q5SSH8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyb5d2Q5SSH8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyb5d2Q5SSH8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyb5d2Q5SSH8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyb5d2Q5SSH8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyb5d2Q5SSH8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms