Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
5730522E02RikQ5SP45 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
5730522E02RikQ5SP45 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
5730522E02RikQ5SP45 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
5730522E02RikQ5SP45 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
5730522E02RikQ5SP45 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
5730522E02RikQ5SP45 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
5730522E02RikQ5SP45 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
5730522E02RikQ5SP45 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
5730522E02RikQ5SP45 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
5730522E02RikQ5SP45 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
5730522E02RikQ5SP45 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
5730522E02RikQ5SP45 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
5730522E02RikQ5SP45 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
5730522E02RikQ5SP45 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
5730522E02RikQ5SP45 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
5730522E02RikQ5SP45 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
5730522E02RikQ5SP45 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
5730522E02RikQ5SP45 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
5730522E02RikQ5SP45 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
5730522E02RikQ5SP45 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
5730522E02RikQ5SP45 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
5730522E02RikQ5SP45 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
5730522E02RikQ5SP45 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
5730522E02RikQ5SP45 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
5730522E02RikQ5SP45 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
5730522E02RikQ5SP45 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms