Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trav8d-2Q5R1B6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trav8d-2Q5R1B6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trav8d-2Q5R1B6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trav8d-2Q5R1B6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trav8d-2Q5R1B6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trav8d-2Q5R1B6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trav8d-2Q5R1B6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trav8d-2Q5R1B6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trav8d-2Q5R1B6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trav8d-2Q5R1B6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trav8d-2Q5R1B6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trav8d-2Q5R1B6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trav8d-2Q5R1B6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trav8d-2Q5R1B6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trav8d-2Q5R1B6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trav8d-2Q5R1B6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trav8d-2Q5R1B6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trav8d-2Q5R1B6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trav8d-2Q5R1B6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trav8d-2Q5R1B6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trav8d-2Q5R1B6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trav8d-2Q5R1B6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trav8d-2Q5R1B6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trav8d-2Q5R1B6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trav8d-2Q5R1B6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trav8d-2Q5R1B6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trav8d-2Q5R1B6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trav8d-2Q5R1B6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trav8d-2Q5R1B6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trav8d-2Q5R1B6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trav8d-2Q5R1B6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trav8d-2Q5R1B6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trav8d-2Q5R1B6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trav8d-2Q5R1B6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trav8d-2Q5R1B6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trav8d-2Q5R1B6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trav8d-2Q5R1B6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trav8d-2Q5R1B6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trav8d-2Q5R1B6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trav8d-2Q5R1B6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trav8d-2Q5R1B6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trav8d-2Q5R1B6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trav8d-2Q5R1B6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trav8d-2Q5R1B6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trav8d-2Q5R1B6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trav8d-2Q5R1B6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trav8d-2Q5R1B6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trav8d-2Q5R1B6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trav8d-2Q5R1B6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trav8d-2Q5R1B6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trav8d-2Q5R1B6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trav8d-2Q5R1B6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trav8d-2Q5R1B6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trav8d-2Q5R1B6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trav8d-2Q5R1B6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trav8d-2Q5R1B6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trav8d-2Q5R1B6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trav8d-2Q5R1B6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trav8d-2Q5R1B6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trav8d-2Q5R1B6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trav8d-2Q5R1B6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trav8d-2Q5R1B6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trav8d-2Q5R1B6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trav8d-2Q5R1B6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trav8d-2Q5R1B6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trav8d-2Q5R1B6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trav8d-2Q5R1B6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trav8d-2Q5R1B6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trav8d-2Q5R1B6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trav8d-2Q5R1B6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trav8d-2Q5R1B6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trav8d-2Q5R1B6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trav8d-2Q5R1B6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms