Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Kdm6bQ5NCY0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Kdm6bQ5NCY0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Kdm6bQ5NCY0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Kdm6bQ5NCY0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Kdm6bQ5NCY0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Kdm6bQ5NCY0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Kdm6bQ5NCY0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Kdm6bQ5NCY0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Kdm6bQ5NCY0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Kdm6bQ5NCY0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Kdm6bQ5NCY0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Kdm6bQ5NCY0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Kdm6bQ5NCY0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Kdm6bQ5NCY0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Kdm6bQ5NCY0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Kdm6bQ5NCY0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Kdm6bQ5NCY0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Kdm6bQ5NCY0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Kdm6bQ5NCY0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Kdm6bQ5NCY0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Kdm6bQ5NCY0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Kdm6bQ5NCY0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Kdm6bQ5NCY0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Kdm6bQ5NCY0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Kdm6bQ5NCY0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Kdm6bQ5NCY0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Kdm6bQ5NCY0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Kdm6bQ5NCY0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Kdm6bQ5NCY0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Kdm6bQ5NCY0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Kdm6bQ5NCY0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Kdm6bQ5NCY0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Kdm6bQ5NCY0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Kdm6bQ5NCY0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Kdm6bQ5NCY0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Kdm6bQ5NCY0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Kdm6bQ5NCY0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Kdm6bQ5NCY0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Kdm6bQ5NCY0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Kdm6bQ5NCY0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Kdm6bQ5NCY0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Kdm6bQ5NCY0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Kdm6bQ5NCY0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Kdm6bQ5NCY0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Kdm6bQ5NCY0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Kdm6bQ5NCY0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Kdm6bQ5NCY0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Kdm6bQ5NCY0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Kdm6bQ5NCY0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Kdm6bQ5NCY0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Kdm6bQ5NCY0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Kdm6bQ5NCY0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Kdm6bQ5NCY0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Kdm6bQ5NCY0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Kdm6bQ5NCY0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Kdm6bQ5NCY0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Kdm6bQ5NCY0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Kdm6bQ5NCY0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Kdm6bQ5NCY0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Kdm6bQ5NCY0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Kdm6bQ5NCY0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Kdm6bQ5NCY0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Kdm6bQ5NCY0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Kdm6bQ5NCY0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Kdm6bQ5NCY0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Kdm6bQ5NCY0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Kdm6bQ5NCY0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Kdm6bQ5NCY0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Kdm6bQ5NCY0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Kdm6bQ5NCY0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Kdm6bQ5NCY0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Kdm6bQ5NCY0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Kdm6bQ5NCY0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Kdm6bQ5NCY0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Kdm6bQ5NCY0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Kdm6bQ5NCY0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Kdm6bQ5NCY0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Kdm6bQ5NCY0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Kdm6bQ5NCY0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Kdm6bQ5NCY0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm6bQ5NCY0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Kdm6bQ5NCY0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Kdm6bQ5NCY0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Kdm6bQ5NCY0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Kdm6bQ5NCY0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Kdm6bQ5NCY0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Kdm6bQ5NCY0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Kdm6bQ5NCY0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Kdm6bQ5NCY0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Kdm6bQ5NCY0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Kdm6bQ5NCY0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Kdm6bQ5NCY0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Kdm6bQ5NCY0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Kdm6bQ5NCY0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Kdm6bQ5NCY0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Kdm6bQ5NCY0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Kdm6bQ5NCY0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Kdm6bQ5NCY0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Kdm6bQ5NCY0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.3 ms