Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCX5

Neurl4, Neuralized-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl4Q5NCX5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Neurl4Q5NCX5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Neurl4Q5NCX5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Neurl4Q5NCX5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Neurl4Q5NCX5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Neurl4Q5NCX5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Neurl4Q5NCX5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Neurl4Q5NCX5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Neurl4Q5NCX5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Neurl4Q5NCX5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Neurl4Q5NCX5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Neurl4Q5NCX5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Neurl4Q5NCX5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Neurl4Q5NCX5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Neurl4Q5NCX5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Neurl4Q5NCX5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Neurl4Q5NCX5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Neurl4Q5NCX5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Neurl4Q5NCX5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Neurl4Q5NCX5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Neurl4Q5NCX5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Neurl4Q5NCX5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Neurl4Q5NCX5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Neurl4Q5NCX5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Neurl4Q5NCX5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Neurl4Q5NCX5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Neurl4Q5NCX5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Neurl4Q5NCX5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Neurl4Q5NCX5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Neurl4Q5NCX5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Neurl4Q5NCX5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Neurl4Q5NCX5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Neurl4Q5NCX5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Neurl4Q5NCX5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Neurl4Q5NCX5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Neurl4Q5NCX5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Neurl4Q5NCX5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Neurl4Q5NCX5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Neurl4Q5NCX5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Neurl4Q5NCX5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Neurl4Q5NCX5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Neurl4Q5NCX5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Neurl4Q5NCX5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Neurl4Q5NCX5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Neurl4Q5NCX5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Neurl4Q5NCX5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Neurl4Q5NCX5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Neurl4Q5NCX5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Neurl4Q5NCX5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Neurl4Q5NCX5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Neurl4Q5NCX5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Neurl4Q5NCX5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Neurl4Q5NCX5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Neurl4Q5NCX5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Neurl4Q5NCX5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Neurl4Q5NCX5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Neurl4Q5NCX5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Neurl4Q5NCX5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Neurl4Q5NCX5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Neurl4Q5NCX5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Neurl4Q5NCX5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Neurl4Q5NCX5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Neurl4Q5NCX5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Neurl4Q5NCX5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Neurl4Q5NCX5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Neurl4Q5NCX5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Neurl4Q5NCX5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Neurl4Q5NCX5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Neurl4Q5NCX5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Neurl4Q5NCX5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Neurl4Q5NCX5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Neurl4Q5NCX5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Neurl4Q5NCX5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Neurl4Q5NCX5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Neurl4Q5NCX5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Neurl4Q5NCX5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Neurl4Q5NCX5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Neurl4Q5NCX5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Neurl4Q5NCX5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Neurl4Q5NCX5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Neurl4Q5NCX5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Neurl4Q5NCX5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Neurl4Q5NCX5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Neurl4Q5NCX5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Neurl4Q5NCX5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Neurl4Q5NCX5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Neurl4Q5NCX5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Neurl4Q5NCX5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Neurl4Q5NCX5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Neurl4Q5NCX5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Neurl4Q5NCX5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Neurl4Q5NCX5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Neurl4Q5NCX5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Neurl4Q5NCX5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Neurl4Q5NCX5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Neurl4Q5NCX5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Neurl4Q5NCX5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Neurl4Q5NCX5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Neurl4Q5NCX5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Neurl4Q5NCX5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms