Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SynaQ5G5D5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SynaQ5G5D5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SynaQ5G5D5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SynaQ5G5D5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SynaQ5G5D5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SynaQ5G5D5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SynaQ5G5D5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SynaQ5G5D5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SynaQ5G5D5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SynaQ5G5D5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SynaQ5G5D5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SynaQ5G5D5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SynaQ5G5D5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SynaQ5G5D5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SynaQ5G5D5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SynaQ5G5D5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SynaQ5G5D5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SynaQ5G5D5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SynaQ5G5D5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SynaQ5G5D5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SynaQ5G5D5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SynaQ5G5D5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SynaQ5G5D5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SynaQ5G5D5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SynaQ5G5D5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SynaQ5G5D5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SynaQ5G5D5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SynaQ5G5D5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SynaQ5G5D5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SynaQ5G5D5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SynaQ5G5D5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SynaQ5G5D5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SynaQ5G5D5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SynaQ5G5D5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SynaQ5G5D5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SynaQ5G5D5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SynaQ5G5D5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SynaQ5G5D5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SynaQ5G5D5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SynaQ5G5D5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SynaQ5G5D5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SynaQ5G5D5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SynaQ5G5D5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SynaQ5G5D5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SynaQ5G5D5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SynaQ5G5D5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms