Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nlrc3Q5DU56 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nlrc3Q5DU56 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Nlrc3Q5DU56 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nlrc3Q5DU56 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nlrc3Q5DU56 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nlrc3Q5DU56 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nlrc3Q5DU56 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nlrc3Q5DU56 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nlrc3Q5DU56 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nlrc3Q5DU56 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nlrc3Q5DU56 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nlrc3Q5DU56 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nlrc3Q5DU56 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nlrc3Q5DU56 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Nlrc3Q5DU56 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nlrc3Q5DU56 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nlrc3Q5DU56 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Nlrc3Q5DU56 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nlrc3Q5DU56 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nlrc3Q5DU56 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nlrc3Q5DU56 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nlrc3Q5DU56 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Nlrc3Q5DU56 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nlrc3Q5DU56 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nlrc3Q5DU56 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nlrc3Q5DU56 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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Nlrc3Q5DU56 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nlrc3Q5DU56 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nlrc3Q5DU56 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nlrc3Q5DU56 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nlrc3Q5DU56 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Nlrc3Q5DU56 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nlrc3Q5DU56 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nlrc3Q5DU56 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nlrc3Q5DU56 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nlrc3Q5DU56 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nlrc3Q5DU56 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nlrc3Q5DU56 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nlrc3Q5DU56 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nlrc3Q5DU56 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nlrc3Q5DU56 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nlrc3Q5DU56 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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Nlrc3Q5DU56 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nlrc3Q5DU56 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nlrc3Q5DU56 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Nlrc3Q5DU56 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nlrc3Q5DU56 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nlrc3Q5DU56 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Nlrc3Q5DU56 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Nlrc3Q5DU56 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nlrc3Q5DU56 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nlrc3Q5DU56 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nlrc3Q5DU56 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nlrc3Q5DU56 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Nlrc3Q5DU56 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrc3Q5DU56 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrc3Q5DU56 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrc3Q5DU56 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrc3Q5DU56 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrc3Q5DU56 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrc3Q5DU56 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrc3Q5DU56 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrc3Q5DU56 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrc3Q5DU56 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrc3Q5DU56 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrc3Q5DU56 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrc3Q5DU56 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrc3Q5DU56 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrc3Q5DU56 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrc3Q5DU56 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrc3Q5DU56 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrc3Q5DU56 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrc3Q5DU56 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrc3Q5DU56 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrc3Q5DU56 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrc3Q5DU56 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrc3Q5DU56 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrc3Q5DU56 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrc3Q5DU56 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrc3Q5DU56 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrc3Q5DU56 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrc3Q5DU56 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrc3Q5DU56 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms