Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTU0

Afap1l2, Actin filament-associated protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afap1l2Q5DTU0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Afap1l2Q5DTU0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Afap1l2Q5DTU0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Afap1l2Q5DTU0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Afap1l2Q5DTU0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Afap1l2Q5DTU0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Afap1l2Q5DTU0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Afap1l2Q5DTU0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Afap1l2Q5DTU0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Afap1l2Q5DTU0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Afap1l2Q5DTU0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Afap1l2Q5DTU0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Afap1l2Q5DTU0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Afap1l2Q5DTU0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Afap1l2Q5DTU0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Afap1l2Q5DTU0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Afap1l2Q5DTU0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Afap1l2Q5DTU0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Afap1l2Q5DTU0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Afap1l2Q5DTU0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Afap1l2Q5DTU0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Afap1l2Q5DTU0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Afap1l2Q5DTU0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Afap1l2Q5DTU0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Afap1l2Q5DTU0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Afap1l2Q5DTU0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Afap1l2Q5DTU0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Afap1l2Q5DTU0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Afap1l2Q5DTU0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Afap1l2Q5DTU0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Afap1l2Q5DTU0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Afap1l2Q5DTU0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Afap1l2Q5DTU0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Afap1l2Q5DTU0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Afap1l2Q5DTU0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Afap1l2Q5DTU0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Afap1l2Q5DTU0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Afap1l2Q5DTU0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Afap1l2Q5DTU0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Afap1l2Q5DTU0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Afap1l2Q5DTU0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Afap1l2Q5DTU0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Afap1l2Q5DTU0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Afap1l2Q5DTU0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Afap1l2Q5DTU0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Afap1l2Q5DTU0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Afap1l2Q5DTU0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Afap1l2Q5DTU0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Afap1l2Q5DTU0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Afap1l2Q5DTU0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Afap1l2Q5DTU0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Afap1l2Q5DTU0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Afap1l2Q5DTU0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Afap1l2Q5DTU0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Afap1l2Q5DTU0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Afap1l2Q5DTU0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afap1l2Q5DTU0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afap1l2Q5DTU0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afap1l2Q5DTU0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afap1l2Q5DTU0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afap1l2Q5DTU0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Afap1l2Q5DTU0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms