Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp13Q5BKP2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp13Q5BKP2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp13Q5BKP2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp13Q5BKP2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp13Q5BKP2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp13Q5BKP2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp13Q5BKP2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp13Q5BKP2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp13Q5BKP2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp13Q5BKP2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp13Q5BKP2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp13Q5BKP2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp13Q5BKP2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp13Q5BKP2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp13Q5BKP2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp13Q5BKP2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp13Q5BKP2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp13Q5BKP2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp13Q5BKP2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp13Q5BKP2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp13Q5BKP2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp13Q5BKP2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp13Q5BKP2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp13Q5BKP2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp13Q5BKP2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp13Q5BKP2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp13Q5BKP2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp13Q5BKP2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp13Q5BKP2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp13Q5BKP2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp13Q5BKP2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp13Q5BKP2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp13Q5BKP2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp13Q5BKP2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp13Q5BKP2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp13Q5BKP2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp13Q5BKP2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp13Q5BKP2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp13Q5BKP2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp13Q5BKP2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp13Q5BKP2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp13Q5BKP2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp13Q5BKP2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp13Q5BKP2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp13Q5BKP2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp13Q5BKP2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms