Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Znf354cQ571J5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf354cQ571J5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf354cQ571J5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf354cQ571J5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf354cQ571J5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf354cQ571J5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf354cQ571J5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf354cQ571J5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf354cQ571J5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf354cQ571J5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf354cQ571J5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf354cQ571J5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf354cQ571J5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf354cQ571J5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf354cQ571J5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf354cQ571J5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf354cQ571J5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf354cQ571J5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf354cQ571J5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf354cQ571J5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf354cQ571J5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf354cQ571J5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf354cQ571J5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf354cQ571J5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf354cQ571J5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf354cQ571J5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf354cQ571J5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf354cQ571J5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf354cQ571J5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf354cQ571J5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf354cQ571J5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf354cQ571J5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf354cQ571J5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf354cQ571J5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf354cQ571J5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf354cQ571J5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf354cQ571J5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf354cQ571J5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf354cQ571J5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf354cQ571J5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf354cQ571J5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf354cQ571J5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf354cQ571J5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf354cQ571J5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf354cQ571J5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf354cQ571J5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf354cQ571J5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf354cQ571J5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf354cQ571J5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf354cQ571J5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf354cQ571J5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf354cQ571J5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf354cQ571J5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf354cQ571J5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf354cQ571J5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Znf354cQ571J5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf354cQ571J5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf354cQ571J5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf354cQ571J5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf354cQ571J5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf354cQ571J5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf354cQ571J5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf354cQ571J5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf354cQ571J5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf354cQ571J5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf354cQ571J5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf354cQ571J5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf354cQ571J5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf354cQ571J5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf354cQ571J5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf354cQ571J5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf354cQ571J5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf354cQ571J5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf354cQ571J5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf354cQ571J5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf354cQ571J5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf354cQ571J5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf354cQ571J5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf354cQ571J5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf354cQ571J5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf354cQ571J5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf354cQ571J5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf354cQ571J5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms