Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc47Q505F5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc47Q505F5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc47Q505F5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc47Q505F5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc47Q505F5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc47Q505F5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc47Q505F5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc47Q505F5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc47Q505F5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc47Q505F5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc47Q505F5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc47Q505F5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc47Q505F5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc47Q505F5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc47Q505F5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc47Q505F5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc47Q505F5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc47Q505F5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc47Q505F5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc47Q505F5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc47Q505F5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc47Q505F5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc47Q505F5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc47Q505F5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc47Q505F5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc47Q505F5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc47Q505F5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc47Q505F5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc47Q505F5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc47Q505F5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc47Q505F5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc47Q505F5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc47Q505F5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc47Q505F5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc47Q505F5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc47Q505F5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc47Q505F5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc47Q505F5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc47Q505F5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc47Q505F5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc47Q505F5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc47Q505F5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc47Q505F5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc47Q505F5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc47Q505F5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc47Q505F5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc47Q505F5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc47Q505F5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrrc47Q505F5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrrc47Q505F5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrrc47Q505F5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc47Q505F5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc47Q505F5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc47Q505F5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc47Q505F5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc47Q505F5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc47Q505F5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc47Q505F5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc47Q505F5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc47Q505F5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc47Q505F5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc47Q505F5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc47Q505F5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc47Q505F5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc47Q505F5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc47Q505F5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc47Q505F5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc47Q505F5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc47Q505F5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc47Q505F5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc47Q505F5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc47Q505F5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc47Q505F5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc47Q505F5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc47Q505F5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc47Q505F5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc47Q505F5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc47Q505F5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrc47Q505F5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrc47Q505F5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc47Q505F5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc47Q505F5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc47Q505F5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc47Q505F5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc47Q505F5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc47Q505F5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc47Q505F5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc47Q505F5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc47Q505F5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc47Q505F5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc47Q505F5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc47Q505F5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc47Q505F5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc47Q505F5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc47Q505F5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc47Q505F5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc47Q505F5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc47Q505F5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc47Q505F5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms