Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp235Q499D5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp235Q499D5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp235Q499D5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfp235Q499D5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp235Q499D5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp235Q499D5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp235Q499D5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfp235Q499D5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zfp235Q499D5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp235Q499D5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp235Q499D5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp235Q499D5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp235Q499D5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp235Q499D5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp235Q499D5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp235Q499D5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp235Q499D5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp235Q499D5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp235Q499D5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp235Q499D5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp235Q499D5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp235Q499D5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp235Q499D5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp235Q499D5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp235Q499D5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp235Q499D5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp235Q499D5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp235Q499D5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp235Q499D5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp235Q499D5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp235Q499D5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp235Q499D5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp235Q499D5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp235Q499D5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Zfp235Q499D5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp235Q499D5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp235Q499D5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp235Q499D5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp235Q499D5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp235Q499D5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp235Q499D5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp235Q499D5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp235Q499D5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp235Q499D5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp235Q499D5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp235Q499D5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp235Q499D5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp235Q499D5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp235Q499D5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp235Q499D5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp235Q499D5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp235Q499D5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp235Q499D5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp235Q499D5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp235Q499D5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp235Q499D5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp235Q499D5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp235Q499D5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp235Q499D5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp235Q499D5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp235Q499D5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp235Q499D5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp235Q499D5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp235Q499D5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp235Q499D5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp235Q499D5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp235Q499D5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms