Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2G9

1810049J17Rik, RIKEN cDNA 1810049J17 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810049J17RikQ3V2G9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1810049J17RikQ3V2G9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
1810049J17RikQ3V2G9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
1810049J17RikQ3V2G9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
1810049J17RikQ3V2G9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1810049J17RikQ3V2G9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1810049J17RikQ3V2G9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
1810049J17RikQ3V2G9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1810049J17RikQ3V2G9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
1810049J17RikQ3V2G9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1810049J17RikQ3V2G9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1810049J17RikQ3V2G9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
1810049J17RikQ3V2G9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1810049J17RikQ3V2G9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
1810049J17RikQ3V2G9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
1810049J17RikQ3V2G9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1810049J17RikQ3V2G9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1810049J17RikQ3V2G9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1810049J17RikQ3V2G9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
1810049J17RikQ3V2G9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1810049J17RikQ3V2G9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
1810049J17RikQ3V2G9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1810049J17RikQ3V2G9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1810049J17RikQ3V2G9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1810049J17RikQ3V2G9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1810049J17RikQ3V2G9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1810049J17RikQ3V2G9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
1810049J17RikQ3V2G9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
1810049J17RikQ3V2G9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
1810049J17RikQ3V2G9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms