Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0B4

Cfap65, Cilia- and flagella-associated protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 1,847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap65Q3V0B4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cfap65Q3V0B4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
Cfap65Q3V0B4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Cfap65Q3V0B4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Cfap65Q3V0B4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cfap65Q3V0B4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cfap65Q3V0B4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cfap65Q3V0B4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cfap65Q3V0B4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cfap65Q3V0B4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cfap65Q3V0B4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cfap65Q3V0B4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cfap65Q3V0B4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cfap65Q3V0B4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cfap65Q3V0B4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cfap65Q3V0B4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cfap65Q3V0B4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cfap65Q3V0B4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cfap65Q3V0B4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Cfap65Q3V0B4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cfap65Q3V0B4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cfap65Q3V0B4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cfap65Q3V0B4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cfap65Q3V0B4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cfap65Q3V0B4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cfap65Q3V0B4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Cfap65Q3V0B4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cfap65Q3V0B4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cfap65Q3V0B4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cfap65Q3V0B4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cfap65Q3V0B4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cfap65Q3V0B4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cfap65Q3V0B4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cfap65Q3V0B4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cfap65Q3V0B4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cfap65Q3V0B4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cfap65Q3V0B4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cfap65Q3V0B4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cfap65Q3V0B4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cfap65Q3V0B4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cfap65Q3V0B4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cfap65Q3V0B4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cfap65Q3V0B4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Cfap65Q3V0B4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cfap65Q3V0B4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cfap65Q3V0B4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cfap65Q3V0B4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cfap65Q3V0B4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cfap65Q3V0B4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cfap65Q3V0B4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cfap65Q3V0B4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Cfap65Q3V0B4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cfap65Q3V0B4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cfap65Q3V0B4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cfap65Q3V0B4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cfap65Q3V0B4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cfap65Q3V0B4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cfap65Q3V0B4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Cfap65Q3V0B4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Cfap65Q3V0B4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cfap65Q3V0B4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cfap65Q3V0B4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cfap65Q3V0B4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cfap65Q3V0B4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Cfap65Q3V0B4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cfap65Q3V0B4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Cfap65Q3V0B4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Cfap65Q3V0B4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cfap65Q3V0B4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Cfap65Q3V0B4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms