Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc160Q3UYG1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc160Q3UYG1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc160Q3UYG1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc160Q3UYG1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc160Q3UYG1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc160Q3UYG1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc160Q3UYG1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc160Q3UYG1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc160Q3UYG1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc160Q3UYG1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc160Q3UYG1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc160Q3UYG1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc160Q3UYG1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc160Q3UYG1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc160Q3UYG1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc160Q3UYG1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc160Q3UYG1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc160Q3UYG1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc160Q3UYG1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc160Q3UYG1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc160Q3UYG1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc160Q3UYG1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc160Q3UYG1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc160Q3UYG1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc160Q3UYG1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc160Q3UYG1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc160Q3UYG1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc160Q3UYG1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc160Q3UYG1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc160Q3UYG1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc160Q3UYG1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc160Q3UYG1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc160Q3UYG1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc160Q3UYG1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc160Q3UYG1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc160Q3UYG1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc160Q3UYG1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc160Q3UYG1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc160Q3UYG1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc160Q3UYG1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc160Q3UYG1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc160Q3UYG1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc160Q3UYG1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc160Q3UYG1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc160Q3UYG1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc160Q3UYG1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc160Q3UYG1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc160Q3UYG1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc160Q3UYG1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc160Q3UYG1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc160Q3UYG1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc160Q3UYG1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc160Q3UYG1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc160Q3UYG1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.2 ms