Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW31

Pate2, Prostate and testis expressed protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate2Q3UW31 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pate2Q3UW31 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pate2Q3UW31 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pate2Q3UW31 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pate2Q3UW31 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pate2Q3UW31 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pate2Q3UW31 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pate2Q3UW31 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pate2Q3UW31 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pate2Q3UW31 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pate2Q3UW31 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pate2Q3UW31 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pate2Q3UW31 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pate2Q3UW31 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pate2Q3UW31 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pate2Q3UW31 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pate2Q3UW31 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pate2Q3UW31 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pate2Q3UW31 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pate2Q3UW31 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pate2Q3UW31 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pate2Q3UW31 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pate2Q3UW31 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pate2Q3UW31 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pate2Q3UW31 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pate2Q3UW31 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pate2Q3UW31 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pate2Q3UW31 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pate2Q3UW31 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pate2Q3UW31 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pate2Q3UW31 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pate2Q3UW31 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pate2Q3UW31 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pate2Q3UW31 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pate2Q3UW31 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pate2Q3UW31 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pate2Q3UW31 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pate2Q3UW31 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pate2Q3UW31 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pate2Q3UW31 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pate2Q3UW31 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pate2Q3UW31 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pate2Q3UW31 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pate2Q3UW31 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pate2Q3UW31 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pate2Q3UW31 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pate2Q3UW31 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pate2Q3UW31 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pate2Q3UW31 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pate2Q3UW31 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pate2Q3UW31 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pate2Q3UW31 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pate2Q3UW31 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pate2Q3UW31 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pate2Q3UW31 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pate2Q3UW31 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pate2Q3UW31 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pate2Q3UW31 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pate2Q3UW31 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pate2Q3UW31 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pate2Q3UW31 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pate2Q3UW31 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pate2Q3UW31 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pate2Q3UW31 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pate2Q3UW31 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pate2Q3UW31 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms