Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Skap2Q3UND0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Skap2Q3UND0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Skap2Q3UND0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Skap2Q3UND0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Skap2Q3UND0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Skap2Q3UND0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skap2Q3UND0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skap2Q3UND0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skap2Q3UND0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skap2Q3UND0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skap2Q3UND0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skap2Q3UND0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skap2Q3UND0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skap2Q3UND0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skap2Q3UND0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skap2Q3UND0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skap2Q3UND0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skap2Q3UND0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Skap2Q3UND0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skap2Q3UND0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Skap2Q3UND0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skap2Q3UND0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Skap2Q3UND0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Skap2Q3UND0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Skap2Q3UND0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skap2Q3UND0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skap2Q3UND0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skap2Q3UND0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skap2Q3UND0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Skap2Q3UND0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Skap2Q3UND0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Skap2Q3UND0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Skap2Q3UND0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skap2Q3UND0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skap2Q3UND0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skap2Q3UND0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skap2Q3UND0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skap2Q3UND0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skap2Q3UND0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Skap2Q3UND0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skap2Q3UND0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Skap2Q3UND0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Skap2Q3UND0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Skap2Q3UND0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Skap2Q3UND0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Skap2Q3UND0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Skap2Q3UND0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Skap2Q3UND0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Skap2Q3UND0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Skap2Q3UND0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Skap2Q3UND0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Skap2Q3UND0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skap2Q3UND0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skap2Q3UND0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Skap2Q3UND0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skap2Q3UND0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skap2Q3UND0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms