Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rsph3aQ3UFY4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rsph3aQ3UFY4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rsph3aQ3UFY4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rsph3aQ3UFY4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rsph3aQ3UFY4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Rsph3aQ3UFY4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rsph3aQ3UFY4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rsph3aQ3UFY4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rsph3aQ3UFY4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rsph3aQ3UFY4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rsph3aQ3UFY4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rsph3aQ3UFY4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rsph3aQ3UFY4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rsph3aQ3UFY4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rsph3aQ3UFY4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rsph3aQ3UFY4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rsph3aQ3UFY4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rsph3aQ3UFY4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rsph3aQ3UFY4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rsph3aQ3UFY4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rsph3aQ3UFY4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rsph3aQ3UFY4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rsph3aQ3UFY4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rsph3aQ3UFY4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rsph3aQ3UFY4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rsph3aQ3UFY4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rsph3aQ3UFY4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rsph3aQ3UFY4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rsph3aQ3UFY4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rsph3aQ3UFY4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rsph3aQ3UFY4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rsph3aQ3UFY4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rsph3aQ3UFY4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rsph3aQ3UFY4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rsph3aQ3UFY4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rsph3aQ3UFY4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rsph3aQ3UFY4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rsph3aQ3UFY4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rsph3aQ3UFY4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rsph3aQ3UFY4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rsph3aQ3UFY4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rsph3aQ3UFY4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rsph3aQ3UFY4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rsph3aQ3UFY4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rsph3aQ3UFY4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rsph3aQ3UFY4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rsph3aQ3UFY4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rsph3aQ3UFY4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rsph3aQ3UFY4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rsph3aQ3UFY4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rsph3aQ3UFY4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rsph3aQ3UFY4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rsph3aQ3UFY4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rsph3aQ3UFY4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rsph3aQ3UFY4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rsph3aQ3UFY4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rsph3aQ3UFY4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsph3aQ3UFY4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsph3aQ3UFY4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsph3aQ3UFY4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsph3aQ3UFY4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsph3aQ3UFY4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsph3aQ3UFY4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsph3aQ3UFY4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsph3aQ3UFY4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rsph3aQ3UFY4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rsph3aQ3UFY4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rsph3aQ3UFY4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rsph3aQ3UFY4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rsph3aQ3UFY4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Rsph3aQ3UFY4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rsph3aQ3UFY4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Rsph3aQ3UFY4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rsph3aQ3UFY4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rsph3aQ3UFY4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rsph3aQ3UFY4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rsph3aQ3UFY4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rsph3aQ3UFY4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rsph3aQ3UFY4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rsph3aQ3UFY4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rsph3aQ3UFY4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rsph3aQ3UFY4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rsph3aQ3UFY4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rsph3aQ3UFY4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rsph3aQ3UFY4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rsph3aQ3UFY4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rsph3aQ3UFY4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rsph3aQ3UFY4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rsph3aQ3UFY4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rsph3aQ3UFY4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rsph3aQ3UFY4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rsph3aQ3UFY4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Rsph3aQ3UFY4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rsph3aQ3UFY4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rsph3aQ3UFY4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rsph3aQ3UFY4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rsph3aQ3UFY4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rsph3aQ3UFY4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rsph3aQ3UFY4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms