Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ttll12Q3UDE2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttll12Q3UDE2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttll12Q3UDE2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttll12Q3UDE2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttll12Q3UDE2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttll12Q3UDE2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttll12Q3UDE2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttll12Q3UDE2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ttll12Q3UDE2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ttll12Q3UDE2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ttll12Q3UDE2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ttll12Q3UDE2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ttll12Q3UDE2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ttll12Q3UDE2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ttll12Q3UDE2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ttll12Q3UDE2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ttll12Q3UDE2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ttll12Q3UDE2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ttll12Q3UDE2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ttll12Q3UDE2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ttll12Q3UDE2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ttll12Q3UDE2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ttll12Q3UDE2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ttll12Q3UDE2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ttll12Q3UDE2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttll12Q3UDE2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttll12Q3UDE2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttll12Q3UDE2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttll12Q3UDE2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttll12Q3UDE2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttll12Q3UDE2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ttll12Q3UDE2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ttll12Q3UDE2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ttll12Q3UDE2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ttll12Q3UDE2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ttll12Q3UDE2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ttll12Q3UDE2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ttll12Q3UDE2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ttll12Q3UDE2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ttll12Q3UDE2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ttll12Q3UDE2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ttll12Q3UDE2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ttll12Q3UDE2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ttll12Q3UDE2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ttll12Q3UDE2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ttll12Q3UDE2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttll12Q3UDE2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttll12Q3UDE2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttll12Q3UDE2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttll12Q3UDE2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ttll12Q3UDE2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ttll12Q3UDE2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ttll12Q3UDE2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ttll12Q3UDE2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ttll12Q3UDE2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ttll12Q3UDE2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ttll12Q3UDE2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ttll12Q3UDE2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ttll12Q3UDE2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ttll12Q3UDE2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ttll12Q3UDE2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ttll12Q3UDE2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ttll12Q3UDE2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ttll12Q3UDE2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ttll12Q3UDE2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ttll12Q3UDE2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ttll12Q3UDE2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ttll12Q3UDE2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ttll12Q3UDE2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ttll12Q3UDE2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ttll12Q3UDE2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ttll12Q3UDE2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ttll12Q3UDE2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ttll12Q3UDE2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ttll12Q3UDE2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ttll12Q3UDE2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ttll12Q3UDE2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ttll12Q3UDE2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ttll12Q3UDE2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ttll12Q3UDE2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttll12Q3UDE2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttll12Q3UDE2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttll12Q3UDE2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttll12Q3UDE2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttll12Q3UDE2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttll12Q3UDE2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttll12Q3UDE2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttll12Q3UDE2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttll12Q3UDE2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttll12Q3UDE2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ttll12Q3UDE2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ttll12Q3UDE2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ttll12Q3UDE2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttll12Q3UDE2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttll12Q3UDE2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttll12Q3UDE2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttll12Q3UDE2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ttll12Q3UDE2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ttll12Q3UDE2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms