Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ssbp4Q3U4B1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ssbp4Q3U4B1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ssbp4Q3U4B1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ssbp4Q3U4B1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ssbp4Q3U4B1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ssbp4Q3U4B1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ssbp4Q3U4B1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ssbp4Q3U4B1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssbp4Q3U4B1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssbp4Q3U4B1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssbp4Q3U4B1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssbp4Q3U4B1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssbp4Q3U4B1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssbp4Q3U4B1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssbp4Q3U4B1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssbp4Q3U4B1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssbp4Q3U4B1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssbp4Q3U4B1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssbp4Q3U4B1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssbp4Q3U4B1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssbp4Q3U4B1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssbp4Q3U4B1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssbp4Q3U4B1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssbp4Q3U4B1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssbp4Q3U4B1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssbp4Q3U4B1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ssbp4Q3U4B1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ssbp4Q3U4B1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssbp4Q3U4B1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssbp4Q3U4B1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ssbp4Q3U4B1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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