Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3R4

Lmf1, Lipase maturation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmf1Q3U3R4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmf1Q3U3R4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmf1Q3U3R4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmf1Q3U3R4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmf1Q3U3R4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmf1Q3U3R4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmf1Q3U3R4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmf1Q3U3R4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmf1Q3U3R4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmf1Q3U3R4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmf1Q3U3R4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmf1Q3U3R4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmf1Q3U3R4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmf1Q3U3R4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmf1Q3U3R4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmf1Q3U3R4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmf1Q3U3R4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmf1Q3U3R4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmf1Q3U3R4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmf1Q3U3R4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmf1Q3U3R4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmf1Q3U3R4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmf1Q3U3R4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmf1Q3U3R4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmf1Q3U3R4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmf1Q3U3R4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmf1Q3U3R4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmf1Q3U3R4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmf1Q3U3R4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmf1Q3U3R4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmf1Q3U3R4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmf1Q3U3R4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmf1Q3U3R4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmf1Q3U3R4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmf1Q3U3R4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmf1Q3U3R4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmf1Q3U3R4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmf1Q3U3R4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmf1Q3U3R4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmf1Q3U3R4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmf1Q3U3R4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmf1Q3U3R4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmf1Q3U3R4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmf1Q3U3R4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmf1Q3U3R4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmf1Q3U3R4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmf1Q3U3R4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmf1Q3U3R4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmf1Q3U3R4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmf1Q3U3R4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmf1Q3U3R4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmf1Q3U3R4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmf1Q3U3R4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmf1Q3U3R4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmf1Q3U3R4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmf1Q3U3R4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmf1Q3U3R4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmf1Q3U3R4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmf1Q3U3R4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmf1Q3U3R4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmf1Q3U3R4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmf1Q3U3R4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmf1Q3U3R4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmf1Q3U3R4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmf1Q3U3R4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmf1Q3U3R4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmf1Q3U3R4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmf1Q3U3R4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmf1Q3U3R4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms