Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Serac1Q3U213 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Serac1Q3U213 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Serac1Q3U213 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Serac1Q3U213 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Serac1Q3U213 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Serac1Q3U213 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Serac1Q3U213 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Serac1Q3U213 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Serac1Q3U213 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Serac1Q3U213 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Serac1Q3U213 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Serac1Q3U213 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Serac1Q3U213 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Serac1Q3U213 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Serac1Q3U213 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Serac1Q3U213 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Serac1Q3U213 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Serac1Q3U213 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Serac1Q3U213 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Serac1Q3U213 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Serac1Q3U213 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Serac1Q3U213 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Serac1Q3U213 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Serac1Q3U213 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Serac1Q3U213 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Serac1Q3U213 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Serac1Q3U213 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Serac1Q3U213 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Serac1Q3U213 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Serac1Q3U213 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Serac1Q3U213 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Serac1Q3U213 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Serac1Q3U213 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Serac1Q3U213 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Serac1Q3U213 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Serac1Q3U213 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Serac1Q3U213 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Serac1Q3U213 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Serac1Q3U213 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Serac1Q3U213 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Serac1Q3U213 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Serac1Q3U213 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Serac1Q3U213 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Serac1Q3U213 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Serac1Q3U213 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Serac1Q3U213 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Serac1Q3U213 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Serac1Q3U213 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Serac1Q3U213 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Serac1Q3U213 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Serac1Q3U213 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Serac1Q3U213 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Serac1Q3U213 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Serac1Q3U213 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Serac1Q3U213 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Serac1Q3U213 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Serac1Q3U213 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Serac1Q3U213 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Serac1Q3U213 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Serac1Q3U213 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Serac1Q3U213 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Serac1Q3U213 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Serac1Q3U213 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Serac1Q3U213 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Serac1Q3U213 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Serac1Q3U213 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Serac1Q3U213 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Serac1Q3U213 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Serac1Q3U213 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Serac1Q3U213 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Serac1Q3U213 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Serac1Q3U213 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Serac1Q3U213 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Serac1Q3U213 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Serac1Q3U213 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Serac1Q3U213 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Serac1Q3U213 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Serac1Q3U213 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Serac1Q3U213 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Serac1Q3U213 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Serac1Q3U213 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Serac1Q3U213 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Serac1Q3U213 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Serac1Q3U213 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Serac1Q3U213 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Serac1Q3U213 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Serac1Q3U213 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Serac1Q3U213 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Serac1Q3U213 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Serac1Q3U213 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Serac1Q3U213 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Serac1Q3U213 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Serac1Q3U213 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Serac1Q3U213 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Serac1Q3U213 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Serac1Q3U213 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Serac1Q3U213 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Serac1Q3U213 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Serac1Q3U213 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms