Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rufy4Q3TYX8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rufy4Q3TYX8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rufy4Q3TYX8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rufy4Q3TYX8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rufy4Q3TYX8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rufy4Q3TYX8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rufy4Q3TYX8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rufy4Q3TYX8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rufy4Q3TYX8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Rufy4Q3TYX8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rufy4Q3TYX8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rufy4Q3TYX8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rufy4Q3TYX8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rufy4Q3TYX8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rufy4Q3TYX8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rufy4Q3TYX8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rufy4Q3TYX8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rufy4Q3TYX8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rufy4Q3TYX8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rufy4Q3TYX8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rufy4Q3TYX8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rufy4Q3TYX8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rufy4Q3TYX8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rufy4Q3TYX8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rufy4Q3TYX8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rufy4Q3TYX8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rufy4Q3TYX8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rufy4Q3TYX8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rufy4Q3TYX8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rufy4Q3TYX8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rufy4Q3TYX8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rufy4Q3TYX8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rufy4Q3TYX8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rufy4Q3TYX8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rufy4Q3TYX8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rufy4Q3TYX8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rufy4Q3TYX8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rufy4Q3TYX8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rufy4Q3TYX8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rufy4Q3TYX8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rufy4Q3TYX8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rufy4Q3TYX8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rufy4Q3TYX8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rufy4Q3TYX8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rufy4Q3TYX8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rufy4Q3TYX8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Rufy4Q3TYX8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rufy4Q3TYX8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rufy4Q3TYX8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rufy4Q3TYX8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rufy4Q3TYX8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rufy4Q3TYX8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rufy4Q3TYX8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rufy4Q3TYX8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rufy4Q3TYX8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rufy4Q3TYX8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rufy4Q3TYX8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rufy4Q3TYX8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rufy4Q3TYX8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rufy4Q3TYX8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rufy4Q3TYX8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rufy4Q3TYX8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rufy4Q3TYX8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rufy4Q3TYX8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rufy4Q3TYX8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rufy4Q3TYX8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 362.8 ms