Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Smarca4Q3TKT4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Smarca4Q3TKT4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Smarca4Q3TKT4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
Smarca4Q3TKT4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Smarca4Q3TKT4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Smarca4Q3TKT4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Smarca4Q3TKT4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Smarca4Q3TKT4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.1
Smarca4Q3TKT4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Smarca4Q3TKT4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Smarca4Q3TKT4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Smarca4Q3TKT4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
Smarca4Q3TKT4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Smarca4Q3TKT4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Smarca4Q3TKT4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
Smarca4Q3TKT4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC40.6■■■■■ 4.09
Smarca4Q3TKT4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
Smarca4Q3TKT4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Smarca4Q3TKT4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
Smarca4Q3TKT4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC40.56■■■■■ 4.08
Smarca4Q3TKT4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Smarca4Q3TKT4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Smarca4Q3TKT4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Smarca4Q3TKT4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Smarca4Q3TKT4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Smarca4Q3TKT4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Smarca4Q3TKT4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
Smarca4Q3TKT4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Smarca4Q3TKT4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
Smarca4Q3TKT4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.08
Smarca4Q3TKT4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
Smarca4Q3TKT4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Smarca4Q3TKT4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Smarca4Q3TKT4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Smarca4Q3TKT4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
Smarca4Q3TKT4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
Smarca4Q3TKT4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Smarca4Q3TKT4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Smarca4Q3TKT4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Smarca4Q3TKT4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Smarca4Q3TKT4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Smarca4Q3TKT4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Smarca4Q3TKT4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
Smarca4Q3TKT4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Smarca4Q3TKT4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Smarca4Q3TKT4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Smarca4Q3TKT4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC40.43■■■■■ 4.06
Smarca4Q3TKT4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
Smarca4Q3TKT4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
Smarca4Q3TKT4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
Smarca4Q3TKT4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Smarca4Q3TKT4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Smarca4Q3TKT4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Smarca4Q3TKT4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Smarca4Q3TKT4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Smarca4Q3TKT4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Smarca4Q3TKT4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Smarca4Q3TKT4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Smarca4Q3TKT4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
Smarca4Q3TKT4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
Smarca4Q3TKT4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
Smarca4Q3TKT4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
Smarca4Q3TKT4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
Smarca4Q3TKT4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Smarca4Q3TKT4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
Smarca4Q3TKT4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Smarca4Q3TKT4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
Smarca4Q3TKT4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Smarca4Q3TKT4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
Smarca4Q3TKT4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Smarca4Q3TKT4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
Smarca4Q3TKT4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Smarca4Q3TKT4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Smarca4Q3TKT4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Smarca4Q3TKT4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Smarca4Q3TKT4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
Smarca4Q3TKT4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Smarca4Q3TKT4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
Smarca4Q3TKT4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
Smarca4Q3TKT4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Smarca4Q3TKT4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Smarca4Q3TKT4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Smarca4Q3TKT4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Smarca4Q3TKT4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Smarca4Q3TKT4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Smarca4Q3TKT4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Smarca4Q3TKT4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Smarca4Q3TKT4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Smarca4Q3TKT4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Smarca4Q3TKT4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Smarca4Q3TKT4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Smarca4Q3TKT4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Smarca4Q3TKT4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Smarca4Q3TKT4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Smarca4Q3TKT4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
Smarca4Q3TKT4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Smarca4Q3TKT4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Smarca4Q3TKT4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Smarca4Q3TKT4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms